中的难点

安装 rpy2 中的问题,安装rpy2问题

参考:

1、 的Redme.md

python3中  jupyter notebook中rpy2的安装:

1、先安装R和RStudio

2、安装 rpy2 
参考:

  1)     
这个网址中下载rpy2的whl包

  2)   通过pip install  xxx安装这个包,

  3)    python 中通过 import rpy2和  import rpy2.robjects as robjects
检查是否安装成功

3、安装后出现的问题的解决办法
参考:

    主要是要添加R_HOME 和R_USER的环境变量

4、jupyter notebook 中运行

      %load_ext rpy2.ipython

报错:AttributeError: ‘ZMQInteractiveShell’
object has no attribute ‘has_readline’

找了很多资料找不到原因,最后是通过conda install rpy2 
重新安装rpy2得以解决,可能是我之前安装的pip install whl版本不对

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rpy2 中的问题,安装rpy2问题 参考:
1、 python3中
jupyter notebook中rpy2的安装: 1、先安装R和…

%R print(“Hi from R”)


3.2 导入rpy2, 新版 ryp2 已改成:

http://news.hiapk.com/internet/s593427f2c668.html

%load_ext rpy2.ipython

install.packages(‘devtools’)

devtools::install_github(‘IRkernel/IRkernel’)

IRkernel::installspec()

从Python获取变量var: %R -i var

pip install rpy2


3.4 将一行设为R代码: %R

1.jupyter notebook之前是叫ipython
notebook,升级后,不仅支持Python,还支持其他很多语言,如R,scala,go…

(转自:用jupyter notebook同时写python 和 R 作者:晴风91)

2.Rstudio里面可以使用R markdown,
类似jupyter-notebook功能。但要想使用Jupyter新建Rscript,
先要安装IRkernel:进入R, 运行:

3.5 从R获取变量var:%R -o var

3.1 先安装rpy2:


3.使用rpy2 python包在R-py之间切换:

%%R

%%R

A <- matrix(1, 15, 15)
A[4,7] <- 0
persp(A, expand=0.5)

http://nbviewer.jupyter.org/github/yenlung/Computing-Life-with-Computers/blob/master/Topic\_R%20in%20IPython.ipynb\#

3.3 将整个cell设为R代码:

references: